Pendirian SMK Negeri 6 Kuningan diawali dengan pendirian SMK Kecil di SMP (SMP Negeri 2 Pancalang, Kabupaten Kuningan) pada 2005. Pendirian sekolah tersebut diprakarsai oleh Bapak E. Sunija dan bapak Sumadi (keduanya merupakan guru di SMK Negeri 1 Kuningan) Pada tanggal 26 Agustus 2006, Pemerintah Kabupaten Kuningan melalui Dinas Pendidikan mengubah nama dan status SMK Kecil di SMP menjadi SMK Negeri 6 Kuningan yang membuka program keahlian Teknik Mekanik Otomotif.
Di bawah pimpinan Bapak Drs. Dedi Jatnika (Alm) pada awal April 2007 SMK Negeri 6 Kuningan beralih tempat, menempati gedung baru yang dibangun dengan biaya yang berasal dari APBN dan APBD. Saat itu baru tersedia 3 ruang teori dan 1 ruang guru.
Awal April 2007, sekolah pindah ke lokasi gedung baru (Sindangkempeng) dengan fasilitas awal 3 ruang teori dan 1 ruang guru, kemudian dikembangkan dengan bantuan APBN/APBD menjadi puluhan ruang kelas, bengkel otomotif, dan lab.
Dalam kurun 5 tahun berikutnya (2010-2011), SMK Negeri 6 Kuningan terus mengembangkan diri dengan membangun berbagai fasilitas yang diperlukan. Perkembangan fasilitas bangunan yang dimiliki SMK Negeri 6 Kuningan tampak dengan didirikannya 9 tuang teori, 3 bengkel otomotif, 3 ruang praktek pemasaran, 3 laboratorium, 1 ruang praktek perhotelan, dan 1 ruang administrasi.